仙林学校初中部占地50102平方米，建筑面积23290平方米，按照12轨36个班级的规模配置设备设施，新校区已于2012年8月26日交付使用。
初中部校区由6栋主要建筑构成，其中1号楼、2号楼为教学大楼，初二年级、初三年级在1号楼二楼和三楼，共计六个班级，初一年级分布在2号楼共计为8各班级。三号楼、四号楼为综合楼，其中包括理化生实验室、美术教室、劳技教室、网络机房等。所有教室皆按照省颁一类标准配备，包括电子白板、短焦投影仪、小班化书包柜等。
5号楼为生活楼，可以容纳500名师生同时就餐。
6号楼为室内体育馆，是学生室内活动的主要场所，可以举办校内大型的体育活动或集会。室外运动区有300米塑胶跑道、小型足球场、篮球场等共同构成，篮球场、学生活动区、室内体育馆都为硅PU地面。
